Charakterizace variant rDNA v Arabidopsis thaliana

Bc. Lenka Vansáčová

Diplomová práce

Characterisation of rDNA variants in Arabidopsis thaliana

Anotace:

Geny pro rRNA (přítomné ve stovkách až tisících tandemových kopií), jsou složené z transkripční jednotky a intergenového mezerníku. U eukaryotických organizmů jsou tyto oblasti (zejména během metafáze buněčného dělení) patrné jako zóny sekundární konstrikce v místě organizátorů jadérka. Proces sestavování chromatinu představuje první krok během formování chromozomu. Kromě DNA a histonů plní důležité úkoly replikační chaperony jako faktory účastnící se formování nukleozomů. Mezi nejvýznamnější patří CAF1, u Arabidopsis thaliana složený z podjednotek FAS1, FAS2 a MSI1. Jeho úkolem je ukládání histonů H3 a H4 na replikující se DNA. Mutace v genech pro některou z podjednotek CAF1 (fas1- a fas2- mutanty) vedou ke ztrátě jeho funkce, a tím k reorganizaci chromatinu uvnitř nukleozomu, morfologickým změnám v kořenovém a stonkovém apikálním meristému a u A. thaliana také ke ztrátě jednotek rDNA.

Abstract:

The rRNA genes (present in hundreds to thousands tandem copies) are composed of a transcriptional unit and intergenic spacer. In eukaryotic organisms these areas are (particularly during the metaphase of cell division) shown in the zone of secondary constriction as nucleolar organizing regions. The process of chromatin assembly represents a first step in the formation of a chromosome. In addition to DNA and histones, replication chaperones are responsible for important tasks as factors involved in the formation of nucleosomes . One of the most important chaperones, CAF1, is in Arabidopsis thaliana composed of subunits FAS1, FAS2 and MSI1. Its function is to assemble the histones H3 and H4 at the replicating DNA. Mutants in the genes for one of the subunits of CAF1 (fas1- and fas2- mutant) lead to the loss of its function, and thus to chromatin reorganization inside of the nucleosome, to morphological changes in the root and shoot apical meristem and in the case of A. thaliana these mutations lead to progressive loss of rDNA units.

Klíčová slova

Arabidopsis thaliana, Chromatin Assembly Factor 1 (CAF1), FAS1, FAS2, ribozomální geny

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2014
• Vedoucí: Mgr. Martina Dvořáčková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika