Dědičná predispozice ke kolorektálnímu karcinomu

Bc. Lenka DROBČINSKÁ

Master's thesis

Hereditary Predisposition to Colon Cancer

Abstract:

Lynchův syndrom neboli hereditární nepolypózní kolorektální karcinom je nejčastější známou hereditární predispozicí ke karcinomu tlustého střeva. Je zodpovědný za přibližně 2% všech karcinomů tlustého střeva v populaci. Příčinou tohoto onemocnění může být mutace v některém z genů systému oprav chybného párování bází. V této práci jsem se zabývala jednonukleotidovou substitucí c.2146G>A genu MLH1, nacházející se téměř na konci posledního, tj. 19. exonu tohoto genu, o níž není známo, zda se jedná o patogenní mutaci nebo o nepatogenní, s onemocněním nesouvisející polymorfimus, tj. populační variantu. Metodou amplifikačního refrakčního mutačního systému jsem vyšetřila 100 náhodně vybraných osob bez onkologického onemocnění. V této skupině se hledaná substituce vyskytla u jedné osoby tj. u 1%. Je tedy možné, že substituce c.2146G>A v exonu 19 genu MLH1 je polymorfizmus. Definitivní rozhodnutí o eventuálních patogenních důsledcích této substituce by mělo být založeno na výsledcích funkčních studií, které jsou prováděny ve specializovaných laboratořích. Nádor prsu je jedním z nejčastěji diagnostikovaných maligních onemocnění u žen. Hlavní příčinou genetické predispozice ke vzniku nádoru prsu jsou mutace v genech BRCA1 a BRCA2, které jsou příčinou syndromu hereditárního karcinomu prsu a vaječníků. Do klinického obrazu syndromu hereditárního karcinomu prsu a vaječníků patří také nádory trávicího traktu, avšak prozatím není dořešena otázka, zda je součástí syndromu i karcinom kolorekta. Dalším mým úkolem bylo stanovit v souboru 45 pacientů s kolorektálním karcinomem a 10 pacientů s karcinomem žaludku, zda někdo z těchto pacientů je nosičem nejčastější zárodečné mutace v genu BRCA1 c.5382dupC. Použila jsem metodu polymerázové řetězové reakce v reálném čase, k ověření pozitivních nálezů jsem použila metodu přímé sekvenace. Mutaci jsem našla u jednoho pacienta s kolorektálním karcinomem. V rodině tohoto pacienta se vyskytla další nádorová onemocnění typická pro syndrom hereditárního karcinomu prsu a vaječníků. Nijmegen breakage syndrom je autozomálně recesivní onemocnění spojené s chromozomální nestabilitou, charakterizované vrozenou mikrocefalií, sníženou imunitou, radiosenzitivitou a predispozicí k nádorovým onemocněním, zejména krevního a lymfatického systému. U přenašečů nejčastější, tzv. ?slovanské? mutace c.657del5 v genu NBS1 bylo popsáno vyšší riziko vzniku nádorových onemocnění, včetně kolorektálního karcinomu. Mým cílem bylo zjistit, zda jsou mezi osobami s kolorektálním karcinomem přenašeči této mutace. Metodou PCR s rozdělením fragmentů na polyakrylamidovém gelu jsem vyšetřila celkem 65 vzorků pacientů s nádory kolorekta, hledanou mutaci jsem nenašla u žádného z nich. Můj soubor pacientů však byl relativně malý, aby bylo možné vyvozovat definitivní závěry.

Abstract:

Lynch syndrome or hereditary nonpolyposis colorectal cancer responsible for approximately 2% of all colon cancers in the population. Lynch syndrome is caused by mutation in mismatch repair genes. I have studied a single-nucleotid substitution c.2146G>A in the MLH1 gene, located nearly at the end of the last exon 19 of the MLH1 gene. It is not known, if this substitution is a pathogenic mutation or a nepathogenic polymorphism, i.e. population variant. Using the amplification resistant mutation system method, I have analysed 100 non-cancer persons. In this group, I have found the substituion in one person, i.e. 1%. This result suggests, that the c.2146G>A substitution in exon 19 of the MLH1 gene may be a polymorphism. Definitive conclusion about possible pathogenic consequences of this substitution should be based on functional studies, that are performed in special laboratories. Breast cancer is the most frequent malignancy diagnosed in women in the western world. Inherited mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes are the major cause of genetic predisposition to this cancer, causing the hereditary breast and ovarian cancer syndrome. Gastrointestinal cancer belongs to the clinical picture of this syndrome. So far it is not clear, however, if colon cancer is associated with hereditary breast and ovarian cancer syndrome or not. Another my aim was to detect the most frequent germline mutation in the BRCA1 gene c. 5382dupC in the group of 45 patients with colon cancer and 10 patients with stomach cancer. I have used the real-time polymerase chain reaction, positive cases were verified using direct sequencing. I have found the mutation in one colon cancer patient. There occured also other cancers in the family of this patient typical of hereditary breast and ovarian cancer syndrome. Nijmegen breacage syndrom is an autosomal recessive chromosomal instability disorder, characterized by congenital microcephaly, immunodeficiency, hyperradiosensitivity and an increased risk of cancer, especially of haematologic malignancies. Carriers of the most frequent NBS1 gene mutation c.657del5, also called ?slovenian? mutation, were observed to be at an increased risk of cancer, especially colon cancer. Aim of my study was to detect, if there NBS1 mutation carriers in a group of colon cancer patients. I have analysed 65 samples of colon cancer patients using polymerase chain reaction and electrophoresis. None of the patients was a carrier of the c.657del5 mutation. My study group is too small to make definitive conclusions, however.

Keywords

mutace, gen MLH1, gen BRCA1, gen NBS1, polymerázová řetězová reakce, PCR v reálném čase

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 5. 2009

Accessible from:: 13. 5. 2009

Thesis defence

• Date of defence: 15. 6. 2009
• Supervisor: MUDr. Pavlína Plevová, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Medicine

Master programme / field:
Public Health Care / Laboratory Examination Methods in Public Health Protection