Cytogenetická a genomická analýza genů pro ribozomální RNA u polyploidních rostlin

Mgr. Radka Vozárová, Ph.D.

Disertační práce

Cytogenetic and genomic analysis of ribosomal RNA genes in polyploid plants

Anotace:

Více než 80 % všech rostlinných druhů podstoupilo ve své evoluci ale-spoň jednou duplikaci celého genomu. V této práci jsem analyzovala polyploidní druhy z rodu Rosa, čeledi Rosaceae. Hlavními charakteristi-kami rodu jsou intenzivní hybridizace, polyploidizace a introgrese. Zá-kladní počet chromozomů je x=7 a úroveň ploidie se pohybuje v rozmezí 2x – 10x. Pentaploidní druhy, které patří do sekce Caninae jsou specifické asymetrickou meiózou, kde bivalentní páry tvoří 14 chromozomů a 21 univalentů zůstává nespárovaných. Zde jsem pomocí bioinformatických a cytogenetických nástrojů analyzovala množství a distribuci 18S a 5S ribozomální DNA u 20 druhů.

Abstract:

More than 80 % of all plant species underwent whole genome duplica-tions (WGD) at least once in their evolutionary history. In this work, I analyzed polyploid species belonging to genus Rosa, family Rosaceae. The main characteristics are intense hybridization, polyploidization and introgression. The basic chromosome number is x=7, ploidy level 2x – 10x. The dogroses are specific in their asymmetrical meiosis. There are 7 pairs of bivalent forming chromosomes and 21 univalents. Here I analyzed the amount and distribution of 18S and 5S ribosomal DNAs in 20 species with bioinformatic and cytogenetic tools, respectively.

Keywords

polyploidie, druhy Rosa, ribozomální DNA, 5S rDNA varianty, FISH, bioinformatika, fylogeneze polyploidy, Rosa species, ribosomal DNA, 5S rDNA variants, bioinformatics, phylogeny

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 1. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 2. 2023
• Vedoucí: RNDr. Aleš Kovařík, CSc.
• Oponent: prof. RNDr. Jana Řepková, CSc., Mgr. Hana Auer Malinská, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Doktorský studijní program / obor:
Molekulární a buněčná biologie a genetika / Molekulární a buněčná biologie a genetika