Analýza pavoučích jedů pomocí proteomických technik

Bc. Michal Svoboda

Bakalářská práce

Analysis of spider venom by proteomic techniques

Anotace:

Tato bakalářská práce se zabývá analýzou pavoučího jedu pomocí MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry neboli laserová desorpce/ionizace za účasti matrice s průletovým analyzátorem) profilování. Při aplikaci této metody je extrakt vzorku přímo smíchán s matričním roztokem, tato směs je nanesena na MALDI desku a po zaschnutí je vzorek analyzován. Celková doba analýzy se pohybuje kolem deseti minut. Metoda přípravy vzorku má významný vliv na kvalitu hmotnostních spekter. Doposud nebyl stanoven standardní postup pro analýzu pavoučího jedu touto metodou. Součástí teoretické části je popis metody MALDI-TOF MS a její využití při analýze pavoučího jedu. Dále zahrnuje stručnou charakteristiku peptidů a informace o složení pavoučích jedů. Praktická část se zaměřuje na vliv matričních roztoků na výsledná hmotnostní spektra. Po vybrání vhodných matric pro analýzu je následně testována na opakovatelnost výsledků.

Abstract:

This thesis deals with analyzing spider venom by using MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry). With this method, the extract of spider venom is directly mixed with a matrix solution and this mixture is applied on a MALDI plate, and after drying, the sample is analyzed. The total analysis time is about ten minutes. The method of sample preparation influences the quality of mass spectra significantly. To this date, no standard procedure for the analysis of spider venom by using this method has been established. The theoretical part describes the method of MALDI-TOF MS and its application in the analysis of spider venom. In addition it includes a brief characterization of peptides and information about composition of spider venom. The practical part focuses on the influence of matrix solution on the resulting mass spectra. The matrices selected as suitable for analysis were subsequently tested for reproducibility of results.

Klíčová slova

Analýza pavoučího jedu, MALDI-TOF MS

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 6. 2014
• Vedoucí: Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Aplikovaná biochemie / Aplikovaná biochemie